Tuy nhiên, cho đến cuối tháng 2-2012, toàn huyện mới giải phóng được 739.704,5 m2 đất (đạt 64,5 % kế hoạch) và giải phóng được 54 ngôi mộ (đạt 5% kế hoạch), chưa tiến hành giải phóng đất ở. Nguyên nhân dự án chậm tiến độ là do trích đo của nhà đầu tư cung cấp cho hội đồng bồi thường, hỗ trợ và tái định cư huyện Kỳ Sơn làm công tác thu hồi đất và bồi thường, hỗ trợ còn sai sót nên phải tiến hành quy chủ, đo đạc lại nhiều lần; tình trạng mua bán đất nhưng không sang tên đổi chủ theo quy định gây khó khăn cho công tác kiểm kê, kiểm đếm; có sự điều chỉnh, bổ sung cục bộ một số đoạn tuyến giữa các bước thiết kế kỹ thuật và bước lập dự án, dẫn đến trích đo thu hồi đất phải điều chỉnh lại nên nhiều lúc làm cho nhân dân không đồng tình.
Ngoài ra, công tác bố trí vốn ứng trước phục vụ cho công tác giải phóng mặt bằng của nhà đầu tư đôi lúc còn chậm; chưa xây dựng được các khu tái định cư và các khu nghĩa trang mới, do đó, nhân dân chưa thể di chuyển nhà cửa, các ngôi mộ để bàn giao mặt bằng…
